Здравствуйте!
Скорее всего после обновления с 2.х на 3.х и попытке восстановления настроек из конфигурационного файла Вы будете получать ошибку. Вероятнее всего, это будет связано с изменением именования портов в разных версиях прошивок. Проше всего будет обновить 1 свитч до 3.х, сконфигурировать его, выгрузить конфиг, сравнить его с версией из 2.х, найти различия, и поправить остальные конфиги вручную, по аналогии.