Здравствуйте!
Проблема понятна, но стоит уточнить несколько моментов.
Из конеткста выше, а именно: устанавливаем уровень 1 (port.RtsEnable = true; port.DtrEnable = true;), становится определенно ясно, что Вы используете программную среду разработки. Хотелось бы знать что за среда, через какое приложение или опять же среду разработки происходит анализ состояния выводов порта.
В дополнение хотелось бы увидеть программный код, или хотя бы часть кода, чтобы проанализировать как Вы используете драйвер UPorta или же все-таки задействуете подсистему API.
Что касается RS-232, то при использовании его по упрощенной схеме соединений, контакты 7 и 6 замыкаются либо на этапе конфигурации устройства (вручную), либо при инициализации порта. Что за устройство Вы хотите подключить и какова схема (упрощенная или полная) его подключения?